RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COG2Q14746 738 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR78Q5VTH9 848 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR142Q7Z601 462 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IQCA1Q86XH1 822 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCOA7Q8NI08 942 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DCAF4Q8WV16 495 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPATC1LQ9H0A9 340 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SRRDQ9UH36 339 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTPN22Q9Y2R2 807 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RIPK3Q9Y572 518 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF536O15090 1300 aa11.06□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERCC3P19447 782 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC4A3P48751 1232 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FLT3LGP49771 235 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF543Q08ER8 600 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM32Q13049 653 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCL14Q16627 93 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM67Q5HYA8 995 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC174Q6PII3 467 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNB2Q92953 911 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KAT14Q9H8E8 782 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.05□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STAT2P52630 851 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRDNQ13061 729 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIF22Q14807 665 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WTAPQ15007 396 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DGKHQ86XP1 1220 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CPXCR1Q8N123 301 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKS1AQ92625 1134 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP26Q9BXU7 913 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FEM1BQ9UK73 627 aa11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 REC8O95072 547 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP2B6P20813 491 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SOX10P56693 466 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MORN1Q5T089 497 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLEKHH3Q7Z736 793 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NBPF11Q86T75 865 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIB2Q92519 343 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GJD2Q9UKL4 321 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PGK2P07205 417 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRB14Q14449 540 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRM4Q14833 912 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MTFR1Q15390 333 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MUM1L1Q5H9M0 696 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM160B2Q86V87 743 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MB21D1Q8N884 522 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAET1EQ8TD07 263 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP6NLQ92738 828 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FGD4Q96M96 766 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTC14Q96N46 770 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEK1Q96PY6 1258 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYTH3O43739 400 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DTNBO60941 627 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COBLO75128 1261 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 INHAP05111 366 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTPREP23469 700 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADORA2AP29274 412 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAPK4P31152 587 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MCM5P33992 734 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STAT3P40763 770 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TROAPQ12815 778 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms