RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 CHD1O14646 1710 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SYNJ2O15056 1496 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 GRIN2BQ13224 1484 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RGS13O14921 159 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 AOC2O75106 756 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PEX14O75381 377 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 ALDH1L1O75891 902 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 ERVK-24P63145 666 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PPP2R2AP63151 447 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RING1Q06587 406 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 NFIAQ12857 509 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PPM1JQ5JR12 505 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SLC6A19Q695T7 634 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM192Q8IY95 271 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 WDR18Q9BV38 432 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 CEP41Q9BYV8 373 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 HMX2A2RU54 273 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 FANCGO15287 622 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 EPHX1P07099 455 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 GBP1P32455 592 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 EPHB1P54762 984 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 NLRP12P59046 1061 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 MAP7Q14244 749 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 GORABQ5T7V8 394 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 HID1Q8IV36 788 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 HAUS7Q99871 368 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RAD18Q9NS91 495 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PRR19A6NJB7 356 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SDSP20132 328 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SPINK2P20155 84 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 GUCY2FP51841 1108 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 ID3Q02535 119 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 UVSSAQ2YD98 709 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 AHI1Q8N157 1196 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RIN3Q8TB24 985 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 MYRFLQ96LU7 910 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 CLEC3AO75596 197 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 ITGAVP06756 1048 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 FGFR1P11362 822 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 NSMFQ6X4W1 530 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RELTQ969Z4 430 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 BTBD11A6QL63 1104 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PRODHO43272 600 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 UBOX5O94941 541 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 IRAK1P51617 712 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 RNF43Q68DV7 783 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF227Q86WZ6 799 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 MORC4Q8TE76 937 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 FGD4Q96M96 766 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 GBP3Q9H0R5 595 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 WDR97A6NE52 1622 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-212ENST00000434424 C9IYK1 514 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 PAX4O43316 350 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 RASGRP1O95267 797 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-212ENST00000434424 PPP2R5AQ15172 486 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms