RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TET1Q8NFU7 2136 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RFC2P35250 354 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAD9AQ99638 391 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 R4GN57 208 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBX10O75333 385 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNJ6P48051 423 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TANC1Q9C0D5 1861 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGF2RP11717 2491 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L10C9JJH3 530 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLIN1O60240 522 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXB7P09629 217 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT24Q2M2I5 525 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSLNLQ96KJ4 702 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM196BA6NMK8 535 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B4GALT4O60513 344 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBALD2Q8IYN6 164 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHCBP1Q8NEM2 672 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TINF2Q9BSI4 451 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L15C9J2P7 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L11C9JVI0 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L18D6R9N7 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L22D6RA61 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L19D6RCP7 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L20D6RJB6 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H7C1W4 665 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GJB5O95377 273 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV5-2P06315 115 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L24Q0WX57 530 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUMF1Q8NBK3 374 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H3BNC9 293 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR5P61964 334 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HYAL1Q12794 435 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS37DQ86XT2 251 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMRP1Q8NCR6 262 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF16BQ96L93 1317 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP53Q96M91 514 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAMD11Q96NU1 681 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GJA9P57773 515 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB33Q86T24 672 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C12orf42Q96LP6 360 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPC25Q9HBM1 224 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYH13Q9UKX3 1938 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYO18BQ8IUG5 2567 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYO10Q9HD67 2058 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASNSP08243 561 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERCC3P19447 782 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AOC1P19801 751 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPM6BQ13491 265 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGA7Q13683 1181 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPC2Q52LR7 807 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNASQ5JWF2 1037 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NLRC5Q86WI3 1866 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITPR1Q14643 2758 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIN2DO15399 1336 aa10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms