RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 AAMPQ13685 434 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 SNX17Q15036 470 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 EVI5LQ96CN4 794 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 LTBP2Q14767 1821 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZBED4O75132 1171 aa24.95■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 FDX1P10109 184 aa24.95■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.95■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.95■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 LRCH3Q96II8 777 aa24.95■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 RTP1P59025 263 aa24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 TFAP4Q01664 338 aa24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC41Q15345 812 aa24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ANO1Q5XXA6 986 aa24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 RIPK3Q9Y572 518 aa24.94■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 RARBP10826 455 aa24.93■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 PDE1AP54750 535 aa24.93■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.93■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.93■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 GMCL1Q96IK5 515 aa24.93■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO40Q9UH90 709 aa24.93■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.93■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 BMP3P12645 472 aa24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1A1P14550 325 aa24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 SLFN13Q68D06 897 aa24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 KIFC2Q96AC6 838 aa24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.91■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 CHST13Q8NET6 341 aa24.91■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 DDX11Q96FC9 970 aa24.91■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.91■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 PHF24Q9UPV7 400 aa24.91■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G6O60733 806 aa24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 STAT2P52630 851 aa24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ALX1Q15699 326 aa24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 RNF180Q86T96 592 aa24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 FAM160B2Q86V87 743 aa24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 CPXCR1Q8N123 301 aa24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.9■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 FGRP09769 529 aa24.89■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.89■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 NOVP48745 357 aa24.89■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.89■■□□□ 1.58
LIMS1-208ENST00000428064 ZMYM6O95789 1325 aa24.88■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 TSPY2A6NKD2 308 aa24.88■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 VPS53Q5VIR6 699 aa24.88■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.88■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM232C9JQI7 657 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 ORC4O43929 436 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS4O75173 837 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 SLC1A4P43007 532 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM60Q495X7 471 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 COL6A3P12111 3177 aa24.87■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.86■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 SMC5Q8IY18 1101 aa24.86■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.86■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.86■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 STX8Q9UNK0 236 aa24.86■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 PGK1P00558 417 aa24.85■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 FGD4Q96M96 766 aa24.85■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 ACAD9Q9H845 621 aa24.85■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.85■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF536O15090 1300 aa24.85■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.85■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0D9SFI3 127 aa24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 TKFCQ3LXA3 575 aa24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 FERMT2Q96AC1 680 aa24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 FAM227BQ96M60 508 aa24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.84■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQY0 241 aa24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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