RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 OR8K1Q8NGG5 319 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRU-204ENST00000428026 MAN1A1P33908 653 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRU-204ENST00000428026 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-204ENST00000428026 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-204ENST00000428026 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-204ENST00000428026 MYCT1Q8N699 235 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-204ENST00000428026 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-204ENST00000428026 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-204ENST00000428026 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-204ENST00000428026 SERPINB2P05120 415 aa15.95■□□□□ 0.14
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