RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.34□□□□□ -0.59
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.34□□□□□ -0.59
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.32□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.32□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.32□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.32□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.32□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM205CA6NFA0 338 aa11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YEATS4O95619 227 aa11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCG2P13521 617 aa11.31□□□□□ -0.6
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPY5RQ15761 445 aa11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.31□□□□□ -0.6
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MKL1Q969V6 931 aa11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.31□□□□□ -0.6
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ME1P48163 572 aa11.3□□□□□ -0.6
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEPT2Q15019 361 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPAQ15257 358 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LDHDQ86WU2 507 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBSNQ9H1K0 784 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RRAGCQ9HB90 399 aa11.3□□□□□ -0.6
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOPCQ9HD26 462 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DACT1Q9NYF0 836 aa11.3□□□□□ -0.6
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DOCK1Q14185 1865 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POTECB2RU33 542 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDHBP11177 359 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XBP1P17861 261 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT2P35908 639 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRE11P49959 708 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC39A14Q15043 492 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FSIP1Q8NA03 581 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DCAF4Q8WV16 495 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNFRSF25Q93038 417 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WRNIP1Q96S55 665 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OCEL1Q9H607 264 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADM5C9JUS6 153 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNHG28P0DPA3 235 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMARCA1P28370 1054 aa11.29□□□□□ -0.6
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