RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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PTPRJ-201ENST00000418331 CYP27B1O15528 508 aa23.64■■□□□ 1.38
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PTPRJ-201ENST00000418331 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 NECTIN1Q15223 517 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LAD1O00515 517 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 SETDB1Q15047 1291 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 CLUL1Q15846 466 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.62■■□□□ 1.37
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