RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412333.1

MESTP4-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MESTP4, Length 1,204 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP4-201ENST00000412333 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.56□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 MTCH2Q9Y6C9 303 aa13.56□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 EPOPA6NHQ4 379 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 ARVCFO00192 962 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 ADCY6O43306 1168 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 TLL1O43897 1013 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 CA3P07451 260 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 CDK7P50613 346 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 TTC6Q86TZ1 520 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 DBNDD2Q9BQY9 259 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 HIPK3Q9H422 1215 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 FBXO28Q9NVF7 368 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 FAM184BQ9ULE4 1060 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 SCN5AQ14524 2016 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 ELP1O95163 1332 aa13.55□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 SMIM22K7EJ46 135 aa13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 SLC25A27O95847 323 aa13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 MAGEB6Q8N7X4 407 aa13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 CD320Q9NPF0 282 aa13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 HDAC5Q9UQL6 1122 aa13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.54□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 RAD21O60216 631 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 SLC4A3P48751 1232 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 BEX3Q00994 111 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 GNASQ5JWF2 1037 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 CCDC158Q5M9N0 1113 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 HLA-CQ95604 372 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 SCLYQ96I15 445 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 COG5Q9UP83 839 aa13.53□□□□□ -0.24
MESTP4-201ENST00000412333 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 WNT8AQ9H1J5 351 aa13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 SPC25Q9HBM1 224 aa13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 ARHGEF15O94989 841 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CD4P01730 458 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CYP2D6P10635 497 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 STAT3P40763 770 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 ICA1Q05084 483 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TNNI3KQ59H18 835 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 SPRED2Q7Z698 418 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TRPV6Q9H1D0 765 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa13.51□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 USP34Q70CQ2 3546 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 AKR1B1P15121 316 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 PTGS1P23219 599 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 NHLH1Q02575 133 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 MTX1Q13505 466 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 ACVR2BQ13705 512 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TTLL4Q14679 1199 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CCDC144BQ3MJ40 725 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 ALDH1L2Q3SY69 923 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 DDX11Q96FC9 970 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 VCPKMTQ9H867 229 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 MCM9Q9NXL9 1143 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TRIOO75962 3097 aa13.5□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CACNA1AO00555 2505 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 PTPRSQ13332 1948 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 PRR33A8MZF0 331 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 VWA5AO00534 786 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 GJA9P57773 515 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 GABPAQ06546 454 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 DYNLL2Q96FJ2 89 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 SH2D4AQ9H788 454 aa13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.48□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 B4GALT4O60513 344 aa13.48□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 GNAI3P08754 354 aa13.48□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 PSMC6P62333 389 aa13.48□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 GRB10Q13322 594 aa13.48□□□□□ -0.25
MESTP4-201ENST00000412333 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms