RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 CATIPQ7Z7H3 387 aa35.18■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 REPS2Q8NFH8 660 aa35.18■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 ERO1AQ96HE7 468 aa35.18■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 MGAMO43451 1857 aa35.18■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF654Q8IZM8 581 aa35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC69A6NI79 296 aa35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM132BQ14DG7 1078 aa35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 Q6ZUG5 572 aa35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 PRR12Q9ULL5 1215 aa35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 ASPRV1Q53RT3 343 aa35.16■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 STAG2Q8N3U4 1231 aa35.16■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 MYL10Q9BUA6 226 aa35.16■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 MAD2L2Q9UI95 211 aa35.16■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 FBXL16Q8N461 479 aa35.15■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa35.15■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 GRM4Q14833 912 aa35.14■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 AGXT2Q9BYV1 514 aa35.14■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 BACH2Q9BYV9 841 aa35.14■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 SPATC1LQ9H0A9 340 aa35.14■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 CPVLQ9H3G5 476 aa35.14■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 PSMC4P43686 418 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 FGD1P98174 961 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 KIF22Q14807 665 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 SYDE2Q5VT97 1194 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 NUP133Q8WUM0 1156 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM47Q96LD4 638 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 UBA5Q9GZZ9 404 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 PORCNQ9H237 461 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 BRPF3Q9ULD4 1205 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 SLC12A7Q9Y666 1083 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 ZBED4O75132 1171 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 DDAH1O94760 285 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 C22orf23Q9BZE7 217 aa35.13■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 DOCK3Q8IZD9 2030 aa35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 PLS1Q14651 629 aa35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 BRF1Q92994 677 aa35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K14Q99558 947 aa35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 FDX1P10109 184 aa35.11■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 SNAP25P60880 206 aa35.11■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 APOA5Q6Q788 366 aa35.11■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 RXRAP19793 462 aa35.1■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 CCNA1P78396 465 aa35.1■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa35.1■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 EFCC1Q9HA90 598 aa35.1■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 KLRF2D3W0D1 207 aa35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 STAT3P40763 770 aa35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 RBM25P49756 843 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 FCGRTP55899 365 aa35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF536O15090 1300 aa35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 ATP2A1O14983 1001 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 APOBRQ0VD83 1088 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 OTOP1Q7RTM1 612 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 CPXCR1Q8N123 301 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
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PKDCC-202ENST00000401498 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 CALM1P0DP23 149 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 CALM2P0DP24 149 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 CALM3P0DP25 149 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 PDRG1Q9NUG6 133 aa35.08■■■■□ 3.21
PKDCC-202ENST00000401498 MAPK4P31152 587 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 MICU3Q86XE3 530 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRF4Q8IZF3 695 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 KIF2CQ99661 725 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 TEX13BQ9BXU2 312 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM17Q9Y577 477 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 OAZ1P54368 228 aa35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF6Q15052 776 aa35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 SLC35G1Q2M3R5 365 aa35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 RIOX2Q8IUF8 465 aa35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 FANCBQ8NB91 859 aa35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 ERCC3P19447 782 aa35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC174Q6PII3 467 aa35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF11Q86T75 865 aa35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 SHCBP1Q8NEM2 672 aa35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 RIPK3Q9Y572 518 aa35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 SMCHD1A6NHR9 2005 aa35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB43O43298 467 aa35.04■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 GNRH1P01148 92 aa35.04■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 KIF5BP33176 963 aa35.04■■■■□ 3.2
PKDCC-202ENST00000401498 AGBL1Q96MI9 1066 aa35.04■■■■□ 3.2
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