RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 TM4SF4P48230 202 aa27.41■■□□□ 1.98
PDSS1-201ENST00000376215 STAT2P52630 851 aa27.41■■□□□ 1.98
PDSS1-201ENST00000376215 INHBEP58166 350 aa27.41■■□□□ 1.98
PDSS1-201ENST00000376215 PPP2R5BQ15173 497 aa27.41■■□□□ 1.98
PDSS1-201ENST00000376215 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PDSS1-201ENST00000376215 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
PDSS1-201ENST00000376215 SREBF2Q12772 1141 aa27.4■■□□□ 1.98
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PDSS1-201ENST00000376215 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
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PDSS1-201ENST00000376215 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.37■■□□□ 1.97
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PDSS1-201ENST00000376215 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.37■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.37■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.36■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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PDSS1-201ENST00000376215 DSG3P32926 999 aa27.36■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 HSCBQ8IWL3 235 aa27.36■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 ATG4CQ96DT6 458 aa27.36■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.36■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.35■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 SMARCA1P28370 1054 aa27.35■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 JMJD4Q9H9V9 463 aa27.35■■□□□ 1.97
PDSS1-201ENST00000376215 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.35■■□□□ 1.97
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PDSS1-201ENST00000376215 HERVK_113P62684 666 aa27.34■■□□□ 1.97
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PDSS1-201ENST00000376215 LBX2Q6XYB7 198 aa27.32■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.32■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.32■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.31■■□□□ 1.96
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PDSS1-201ENST00000376215 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa27.31■■□□□ 1.96
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PDSS1-201ENST00000376215 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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PDSS1-201ENST00000376215 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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PDSS1-201ENST00000376215 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.3■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.29■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.29■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 TXNRD2Q9NNW7 524 aa27.29■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF536O15090 1300 aa27.29■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 CNMDO75829 334 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 CDKL5O76039 1030 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 CRHR2Q13324 411 aa27.28■■□□□ 1.96
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