RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366290.2

YBX3-204, Transcript of Y-box binding protein 3, human

TSL 2

Gene YBX3, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YBX3-204	ENST00000366290	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	FAM221A	A4D161	298 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	CRK	P46108	304 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	ARID5A	Q03989	594 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	VPS37D	Q86XT2	251 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	CASZ1	Q86V15	1759 aa		10.44	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	IGSF3	O75054	1194 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	DLGAP3	O95886	979 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	FBXO27	Q8NI29	283 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	GML	Q99445	158 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	LRRC3	Q9BY71	257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	SPON1	Q9HCB6	807 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		10.43	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF862	O60290	1169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	CILP	O75339	1184 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	WISP1	O95388	367 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	ELN	P15502	786 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	LIG1	P18858	919 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	MPP2	Q14168	576 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	GRIK4	Q16099	956 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	NKD1	Q969G9	470 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.42	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	ADAM23	O75077	832 aa		10.41	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	BPNT1	O95861	308 aa		10.41	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		10.41	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	BTAF1	O14981	1849 aa		10.41	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	SELP	P16109	830 aa		10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	GINM1	Q9NU53	330 aa		10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		10.4	□□□□□ -0.74
YBX3-204	ENST00000366290	YY1	P25490	414 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	CDK8	P49336	464 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	TXNRD1	Q16881	649 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	MORC1	Q86VD1	984 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	AOC2	O75106	756 aa		10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	FGR	P09769	529 aa		10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	RAD18	Q9NS91	495 aa		10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		10.38	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	ZBTB7A	O95365	584 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	FURIN	P09958	794 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	SOX9	P48436	509 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	INPP5A	Q14642	412 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	10.37	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.36	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	LY75	O60449	1722 aa		10.36	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		10.36	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	CYP27B1	O15528	508 aa		10.36	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	SLFN14	P0C7P3	912 aa		10.36	□□□□□ -0.75
YBX3-204	ENST00000366290	GATA4	P43694	442 aa		10.36	□□□□□ -0.75

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