RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 ECE2O60344 883 aa22.82■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.82■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.82■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 TTLL1O95922 423 aa22.81■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 ATP1A3P13637 1013 aa22.81■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 CHRNA5P30532 468 aa22.81■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 E2F4Q16254 413 aa22.81■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.81■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 INF2Q27J81 1249 aa22.8■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.8■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 DPYDQ12882 1025 aa22.79■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 FANCLQ9NW38 375 aa22.79■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 ARID5BQ14865 1188 aa22.79■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 CBFA2T2O43439 604 aa22.78■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 IDI2Q9BXS1 227 aa22.78■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.78■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.78■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.78■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 CCDC17Q96LX7 622 aa22.78■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.78■■□□□ 1.24
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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SERBP1-201ENST00000361219 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 SERPINC1P01008 464 aa22.76■■□□□ 1.23
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SERBP1-201ENST00000361219 CCZ1BP86790 482 aa22.76■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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SERBP1-201ENST00000361219 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.76■■□□□ 1.23
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SERBP1-201ENST00000361219 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.76■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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SERBP1-201ENST00000361219 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.75■■□□□ 1.23
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SERBP1-201ENST00000361219 MED15Q96RN5 788 aa22.75■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 CASP1P29466 404 aa22.74■■□□□ 1.23
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SERBP1-201ENST00000361219 CFAP100Q494V2 611 aa22.73■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 NEK8Q86SG6 692 aa22.73■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.73■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 MTRQ99707 1265 aa22.73■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.73■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 DISC1Q9NRI5 854 aa22.73■■□□□ 1.23
SERBP1-201ENST00000361219 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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