RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 RIPK3Q9Y572 518 aa31.75■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SLC15A5A6NIM6 579 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 PDHBP11177 359 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 RGS2P41220 211 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 RGS19P49795 217 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 IQCA1Q86XH1 822 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 DGKHQ86XP1 1220 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 CPXCR1Q8N123 301 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 APBA2Q99767 749 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 UNC93B1Q9H1C4 597 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa31.74■■■□□ 2.67
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TPGS1-201ENST00000359315 NT5C2P49902 561 aa31.73■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SNAP25P60880 206 aa31.73■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 IKQ13123 557 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 NPLOC4Q8TAT6 608 aa31.73■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 EN2P19622 333 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
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TPGS1-201ENST00000359315 SLC16A2P36021 539 aa31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 FAM160B2Q86V87 743 aa31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 ANKS1AQ92625 1134 aa31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 TEX13BQ9BXU2 312 aa31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 MROH8Q9H579 483 aa31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 GPCPD1Q9NPB8 672 aa31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 FLRT1Q9NZU1 646 aa31.72■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SLC27A2O14975 620 aa31.71■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 ZBED4O75132 1171 aa31.71■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 HMGCRP04035 888 aa31.71■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SNHG28P0DPA3 235 aa31.71■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 UBXN2AP68543 259 aa31.71■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM106CQ9BVX2 250 aa31.71■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 PRR12Q9ULL5 1215 aa31.71■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G6O60733 806 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 COBLO75128 1261 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A27O95847 323 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SLC4A3P48751 1232 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 NECTIN1Q15223 517 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 SEC23AQ15436 765 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 CHST3Q7LGC8 479 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 PNMA1Q8ND90 353 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 CHURC1Q8WUH1 139 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 UBAC1Q9BSL1 405 aa31.7■■■□□ 2.67
TPGS1-201ENST00000359315 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 ATP2A1O14983 1001 aa31.69■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 ANTXR2P58335 489 aa31.69■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF543Q08ER8 600 aa31.69■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 TRDNQ13061 729 aa31.69■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 CREB3L3Q68CJ9 461 aa31.69■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 RNF208Q9H0X6 261 aa31.69■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF536O15090 1300 aa31.69■■■□□ 2.66
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TPGS1-201ENST00000359315 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
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TPGS1-201ENST00000359315 KAT14Q9H8E8 782 aa31.68■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 SENP2Q9HC62 589 aa31.68■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
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TPGS1-201ENST00000359315 SHISA4Q96DD7 197 aa31.67■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 STRNO43815 780 aa31.66■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC174Q6PII3 467 aa31.66■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 AGBL1Q96MI9 1066 aa31.66■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 MMP19Q99542 508 aa31.66■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 CPVLQ9H3G5 476 aa31.66■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 PGK2P07205 417 aa31.65■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 FCER1AP12319 257 aa31.65■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
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TPGS1-201ENST00000359315 SYDE2Q5VT97 1194 aa31.65■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 ABRAQ8N0Z2 381 aa31.65■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF236Q9UL36 1845 aa31.65■■■□□ 2.66
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TPGS1-201ENST00000359315 DPP9Q86TI2 863 aa31.64■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 HOMER2Q9NSB8 354 aa31.64■■■□□ 2.66
TPGS1-201ENST00000359315 IGHA2P01877 340 aa31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 GJB1P08034 283 aa31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 COPB2P35606 906 aa31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 FDX1P10109 184 aa31.62■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD2Q14681 263 aa31.62■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 UBA5Q9GZZ9 404 aa31.62■■■□□ 2.65
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