RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 NEDD9Q14511 834 aa18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 APOA5Q6Q788 366 aa18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SEMA3EO15041 775 aa18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.82■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SIK1P57059 783 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ARL8AQ96BM9 186 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 PRKAB2O43741 272 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CCDC189A1A4V9 331 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CHUKO15111 745 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ELF1P32519 619 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 KCNQ4P56696 695 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 DPYDQ12882 1025 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 NTRK3Q16288 839 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 TTMPQ5BVD1 217 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CSRNP2Q9H175 543 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.81■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 NAPBQ9H115 298 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MCM8Q9UJA3 840 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 HERVK_113P62684 666 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SMIM5Q71RC9 77 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 POLD4Q9HCU8 107 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.8■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 A0A087X0B3 334 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 OPA1O60313 960 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CAMTA2O94983 1202 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ATP1A2P50993 1020 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SKOR1P84550 965 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SATB1Q01826 763 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 KCNQ2O43526 872 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MAP3K12Q12852 859 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.79■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB43O43298 467 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ZEB2O60315 1214 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 TRIM14Q14142 442 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 TACC3Q9Y6A5 838 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ATRNO75882 1429 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 ATP2B2Q01814 1243 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 RUFY1Q96T51 708 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 GUCY1A2P33402 732 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 NF2P35240 595 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 CCDC70Q6NSX1 233 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 LCORLQ8N3X6 602 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MIEF2Q96C03 454 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 PAGE5Q96GU1 130 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 JADE2Q9NQC1 790 aa18.77■□□□□ 0.6
GDE1-201ENST00000353258 MMP1P03956 469 aa18.77■□□□□ 0.59
GDE1-201ENST00000353258 NR5A1Q13285 461 aa18.77■□□□□ 0.59
GDE1-201ENST00000353258 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
GDE1-201ENST00000353258 KCTD16Q68DU8 428 aa18.77■□□□□ 0.59
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1328Q86T90 577 aa18.77■□□□□ 0.59
GDE1-201ENST00000353258 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
GDE1-201ENST00000353258 EPSTI1Q96J88 318 aa18.77■□□□□ 0.59
GDE1-201ENST00000353258 KLC4Q9NSK0 619 aa18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms