RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 SHC4Q6S5L8 630 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 CEP95Q96GE4 821 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 FAM205CA6NFA0 338 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 CUTAO60888 179 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 CAPN2P17655 700 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 TNFRSF25Q93038 417 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 CLIC6Q96NY7 704 aa21.16■□□□□ 0.98
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SPNS1-204ENST00000352260 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 NFIAQ12857 509 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 GPS2Q13227 327 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
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SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.982e-6■■□□□ 12.2
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SPNS1-204ENST00000352260 HPSEQ9Y251 543 aa21.16■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 PPIP5K2O43314 1243 aa21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF202O95125 648 aa21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 ARID5BQ14865 1188 aa21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 RESP18Q5W5W9 173 aa21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 TTLL6Q8N841 843 aa21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 SWAP70Q9UH65 585 aa21.15■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 AKR1B1P15121 316 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 PLA2G4AP47712 749 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 NLRP5P59047 1200 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 SDF4Q9BRK5 362 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.13■□□□□ 0.97
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SPNS1-204ENST00000352260 CYTH3O43739 400 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 HLA-DOAP06340 250 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 ATP2B1P20020 1258 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.13■□□□□ 0.97
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SPNS1-204ENST00000352260 SHMT1P34896 483 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 SYKP43405 635 aa21.12■□□□□ 0.97
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SPNS1-204ENST00000352260 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 UBXN4Q92575 508 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 EFCC1Q9HA90 598 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM75PA6NK02 468 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
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SPNS1-204ENST00000352260 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 KLRF2D3W0D1 207 aa21.11■□□□□ 0.97
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SPNS1-204ENST00000352260 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 IDI2Q9BXS1 227 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 EHD4Q9H223 541 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 ST7Q9NRC1 585 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS3O15072 1205 aa21.1■□□□□ 0.97
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SPNS1-204ENST00000352260 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 MYH8P13535 1937 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 CALML3P27482 149 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 PSMD1Q99460 953 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-204ENST00000352260 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
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