RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 RNF217Q8TC41 542 aa22.95■■□□□ 1.26
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CMTM4-201ENST00000330687 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM4-201ENST00000330687 VCPKMTQ9H867 229 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM4-201ENST00000330687 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CMTM4-201ENST00000330687 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.94■■□□□ 1.26
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CMTM4-201ENST00000330687 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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CMTM4-201ENST00000330687 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.92■■□□□ 1.26
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CMTM4-201ENST00000330687 TMC4Q7Z404 712 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM4-201ENST00000330687 NAPBQ9H115 298 aa22.91■■□□□ 1.26
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CMTM4-201ENST00000330687 KRT12Q99456 494 aa22.91■■□□□ 1.26
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CMTM4-201ENST00000330687 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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CMTM4-201ENST00000330687 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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CMTM4-201ENST00000330687 LY9Q9HBG7 655 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM4-201ENST00000330687 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM4-201ENST00000330687 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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CMTM4-201ENST00000330687 EMBQ6PCB8 327 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM4-201ENST00000330687 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.88■■□□□ 1.25
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