RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322175.7

TPRX1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRX1, Length 1,924 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1-201ENST00000322175 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 OSBPP22059 807 aa18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 USP17L24Q0WX57 530 aa18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 CPA4Q9UI42 421 aa18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 LOC285556D6RIA3 1793 aa18.02■□□□□ 0.48
TPRX1-201ENST00000322175 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 TLR2O60603 784 aa18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 LIFRP42702 1097 aa18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 NT5C2P49902 561 aa18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PPFIA3O75145 1194 aa18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 KCTD1Q719H9 257 aa18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 KAT14Q9H8E8 782 aa18.01■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ERICH2A1L162 156 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 SLC1A4P43007 532 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 LBX1P52954 281 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC178Q5BJE1 867 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 APOA5Q6Q788 366 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PNMA1Q8ND90 353 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ANKS1AQ92625 1134 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 MTA3Q9BTC8 594 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PNMA3Q9UL41 463 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 FLOT1O75955 427 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 HERVK_113P62684 666 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 COG2Q14746 738 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 WTAPQ15007 396 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 CFHR5Q9BXR6 569 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa18■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GPR25O00155 361 aa17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 BMP3P12645 472 aa17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 SART3Q15020 963 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 C17orf99Q6UX52 265 aa17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GDPD2Q9HCC8 539 aa17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 TMEM232C9JQI7 657 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GOLGA8HP0CJ92 632 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PDHBP11177 359 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 CDC27P30260 824 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ADD1P35611 737 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 KLHL40Q2TBA0 621 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 FERMT3Q86UX7 667 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 FAM184AQ8NB25 1140 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GPT2Q8TD30 523 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GMCL1Q96IK5 515 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 CENPFP49454 3210 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 RXRAP19793 462 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 TTBK2Q6IQ55 1244 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 GPCPD1Q9NPB8 672 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 RBPJLQ9UBG7 517 aa17.98■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 DSG3P32926 999 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC96Q2M329 555 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 Q3C1V9 767 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 FAM173BQ6P4H8 233 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 TMEM87AQ8NBN3 555 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 KIFC2Q96AC6 838 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ATG4CQ96DT6 458 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 MYL10Q9BUA6 226 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa17.97■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 ZBTB43O43298 467 aa17.96■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 SLC16A2P36021 539 aa17.96■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 RESTQ13127 1097 aa17.96■□□□□ 0.47
TPRX1-201ENST00000322175 NTRK3Q16288 839 aa17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms