RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 BRAPQ7Z569 592 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 BARHL2Q9NY43 387 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K11Q16584 847 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 SHISA4Q96DD7 197 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 BACE1P56817 501 aa23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR8Q96EF0 704 aa23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF28PB7ZC32 967 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB5O15062 677 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM75PA6NK02 468 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 STXBP3O00186 592 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 CALML3P27482 149 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP5P59047 1200 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAF5O00463 557 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 PLA2G6O60733 806 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT2P35908 639 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT85P78386 507 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 FEM1BQ9UK73 627 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 BTBD18B2RXH4 712 aa23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 C19orf81C9J6K1 198 aa23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 NAPAP54920 295 aa23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM160B2Q86V87 743 aa23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 MOB2Q70IA6 237 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 VCAM1P19320 739 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 GALNT17Q6IS24 598 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.83■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ATL3Q6DD88 541 aa23.83■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf42Q96LP6 360 aa23.83■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 ELP3Q9H9T3 547 aa23.83■■□□□ 1.41
PACSIN3-201ENST00000298838 PTMSP20962 102 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 NR5A1Q13285 461 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 DGKZQ13574 1117 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 NPY5RQ15761 445 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 ERO1BQ86YB8 467 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 OXER1Q8TDS5 423 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP45Q9UL16 551 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRFP10586 1907 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 FIBPO43427 364 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGCS2P54868 508 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PPATQ06203 517 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 KIFC2Q96AC6 838 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 ESYT2A0FGR8 921 aa23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 GNA11P29992 359 aa23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 BLIDQ8IZY5 108 aa23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 C6orf50Q9HD87 102 aa23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP1BP68106 108 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 NBR1Q14596 966 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 COA7Q96BR5 231 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 AMNQ9BXJ7 453 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 UNCXA6NJT0 531 aa23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms