RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296343.9

RUBCN-202, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RUBCN, Length 2,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCN-202ENST00000296343 TEX33O43247 280 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 STAT6P42226 847 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 CCZ1BP86790 482 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TEKT1Q969V4 418 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 COA1Q9GZY4 146 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 H0YIN7 160 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 UBA7P41226 1012 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 CRKP46108 304 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TBCKQ8TEA7 893 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 MTA3Q9BTC8 594 aa14.98□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 NHSQ6T4R5 1651 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 SLFN14P0C7P3 912 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 PDHBP11177 359 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 MASTLQ96GX5 879 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 INTS13Q9NVM9 706 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L10C9JJH3 530 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 ECE2O60344 883 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 PLCG2P16885 1265 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 ALDH1B1P30837 517 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 PDE6BP35913 854 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 USH1GQ495M9 461 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 DESI2Q9BSY9 194 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 VPS16Q9H269 839 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 POLD4Q9HCU8 107 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 BARHL2Q9NY43 387 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 A0A1B0GUL6 1792 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 TPM3P06753 285 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 RCAN1P53805 252 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 POTEDQ86YR6 584 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 SLF2Q8IX21 1173 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 AKT1S1Q96B36 256 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.96□□□□□ -0.01
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L15C9J2P7 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L11C9JVI0 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L18D6R9N7 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L22D6RA61 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L19D6RCP7 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L20D6RJB6 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 MARCH6O60337 910 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 TDP2O95551 362 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L24Q0WX57 530 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.96□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 CALML3P27482 149 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 PTPN14Q15678 1187 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 IQUBQ8NA54 791 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 LRRC15Q8TF66 581 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 POTEMA6NI47 508 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 MORC3Q14149 939 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 SEPT2Q15019 361 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 NID2Q14112 1375 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 PPIP5K2O43314 1243 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 CEP135Q66GS9 1140 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 DYMQ7RTS9 669 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 FERMT2Q96AC1 680 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 SNED1Q8TER0 1413 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 SBF2Q86WG5 1849 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 TPM2P07951 284 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 SHMT1P34896 483 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 DNAJC18Q9H819 358 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 VEZTQ9HBM0 779 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 GNAQP50148 359 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 MTF1Q14872 753 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-202ENST00000296343 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms