RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 HPSEQ9Y251 543 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TRAF5O00463 557 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ERVK-24P63145 666 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TUBB4BP68371 445 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TUBB2AQ13885 445 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 RTL9Q8NET4 1388 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 L1RE1Q9UN81 338 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TSG101Q99816 390 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TSPY3P0CV98 308 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TSPY8P0CW00 308 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 IL2RBP14784 551 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 KLK7P49862 253 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 IFT88Q13099 833 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC41Q15345 812 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CIAO1O76071 339 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TECP42680 631 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 KIFC2Q96AC6 838 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 MAP3K14Q99558 947 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 UTYO14607 1347 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM22K7EJ46 135 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 FANCGO15287 622 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 FTCDO95954 541 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 GNAT2P19087 354 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 PPFIA1Q13136 1202 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 G3V3G9 751 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 PDE8AO60658 829 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TNNI2P48788 182 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 PALLDQ8WX93 1383 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 EHHADHQ08426 723 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC31Q6UY01 552 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 AGXT2Q9BYV1 514 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 H7C1D1 291 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CEP104O60308 925 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 MAP2K2P36507 400 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 LIFRP42702 1097 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 AMPD3Q01432 767 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 NAA35Q5VZE5 725 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 KRT12Q99456 494 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 PTPRUQ92729 1446 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 E2F5Q15329 346 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TMC4Q7Z404 712 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 NFU1Q9UMS0 254 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 DNM2P50570 870 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 USP14P54578 494 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 TFAP4Q01664 338 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CABP7Q86V35 215 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 CALML3P27482 149 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 NF2P35240 595 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRN-201ENST00000295718 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms