RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 RAD50Q92878 1312 aa22.33■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 MSCO60682 206 aa22.33■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.33■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.33■■□□□ 1.17
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM232C9JQI7 657 aa22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 MCCP23508 829 aa22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 DCAF4Q8WV16 495 aa22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 FBXO40Q9UH90 709 aa22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.32■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 NMT2O60551 498 aa22.31■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 COBLO75128 1261 aa22.31■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 DPF3Q92784 378 aa22.31■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.31■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 IGHA2P01877 340 aa22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 IQCA1Q86XH1 822 aa22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CPXCR1Q8N123 301 aa22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CHST13Q8NET6 341 aa22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CENPFP49454 3210 aa22.3■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CYP2C19P33261 490 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 DGKHQ86XP1 1220 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 DDX11Q96FC9 970 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 MAML3Q96JK9 1138 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 KRT23Q9C075 422 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF3Q9H094 633 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.29■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 MYH8P13535 1937 aa22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CHMLP26374 656 aa22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CNGA1P29973 690 aa22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 TKFCQ3LXA3 575 aa22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 LHX8Q68G74 356 aa22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.28■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC96Q2M329 555 aa22.27■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.27■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 KCTD1Q719H9 257 aa22.27■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 PNMA2Q9UL42 364 aa22.27■■□□□ 1.16
MALSU1-201ENST00000287543 CYBAP13498 195 aa22.26■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 SLC4A3P48751 1232 aa22.26■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.26■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 RIPK3Q9Y572 518 aa22.26■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.26■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.25■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 TINF2Q9BSI4 451 aa22.25■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.25■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.25■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 MTMR7Q9Y216 660 aa22.25■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 NEDD4P46934 1319 aa22.25■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 SEPT4O43236 478 aa22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 KDM4AO75164 1064 aa22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 PGK2P07205 417 aa22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 TRDNQ13061 729 aa22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ANKS1AQ92625 1134 aa22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ACAD9Q9H845 621 aa22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 PLXNB2O15031 1838 aa22.24■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 EVI5O60447 810 aa22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 PDHBP11177 359 aa22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 RLFQ13129 1914 aa22.23■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 B4E1Z4 1266 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 SGSM2O43147 1006 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 TRPV1Q8NER1 839 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 KAT14Q9H8E8 782 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.22■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 SNHG28P0DPA3 235 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF543Q08ER8 600 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 IL25Q9H293 177 aa22.21■■□□□ 1.15
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