RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 ISM2Q6H9L7 571 aa16.15■□□□□ 0.18
MSMO1-201ENST00000261507 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
MSMO1-201ENST00000261507 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.15■□□□□ 0.18
MSMO1-201ENST00000261507 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.15■□□□□ 0.18
MSMO1-201ENST00000261507 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.15■□□□□ 0.18
MSMO1-201ENST00000261507 TSPY2A6NKD2 308 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 BIN1O00499 593 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CTAGE5O15320 804 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 YEATS4O95619 227 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 TPM2P07951 284 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 HUNKP57058 714 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CLIC6Q96NY7 704 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 A0A1W2PQ27 194 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 A0A1W2PQ64 194 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 A0A1W2PQD8 194 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 FAM196BA6NMK8 535 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 UQCRHP07919 91 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 LIFRP42702 1097 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ARID5BQ14865 1188 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 IQCA1Q86XH1 822 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ERO1BQ86YB8 467 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 KCNG4Q8TDN1 519 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 USP17L5A8MUK1 530 aa16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 PFKFB1P16118 471 aa16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 PPATQ06203 517 aa16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SH2D4AQ9H788 454 aa16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.13■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 PRDM1O75626 825 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF202O95125 648 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 INPP5BP32019 993 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 TFAP4Q01664 338 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 VGLL4Q14135 290 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 WTAPQ15007 396 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SLC39A14Q15043 492 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC102AQ96A19 550 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.175e-8■■■■□ 26.2
MSMO1-201ENST00000261507 BTBD18B2RXH4 712 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CDKL5O76039 1030 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 GH2P01242 217 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 PTPAQ15257 358 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 RGMBQ6NW40 437 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 MAP3K14Q99558 947 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.12■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 GDF11O95390 407 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 AKR1B1P15121 316 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 C1QTNF8P60827 252 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SPECC1Q5M775 1068 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SHC4Q6S5L8 630 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 WDR18Q9BV38 432 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ERICH2A1L162 156 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 PPIL2Q13356 520 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 NBPF11Q86T75 865 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 TSC1Q92574 1164 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 UBAC1Q9BSL1 405 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ANO10Q9NW15 660 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.11■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 BECN2A8MW95 431 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 PTPRAP18433 802 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ECE1P42892 770 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 RTN1Q16799 776 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 NYAP2Q9P242 653 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CXCL11O14625 94 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 IFNAR1P17181 557 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 CMA1P23946 247 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.172e-16■□□□□ 10.8
MSMO1-201ENST00000261507 MOB2Q70IA6 237 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 TMTC2Q8N394 836 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 SHISA4Q96DD7 197 aa16.1■□□□□ 0.17
MSMO1-201ENST00000261507 ELP3Q9H9T3 547 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms