RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 DDX11Q96FC9 970 aa25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 RARBP10826 455 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 RTP1P59025 263 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 TFAP4Q01664 338 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC41Q15345 812 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 CPXCR1Q8N123 301 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 KIFC2Q96AC6 838 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 CRBNQ96SW2 442 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 SLFN13Q68D06 897 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 EVI5LQ96CN4 794 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 FDX1P10109 184 aa25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 BMP3P12645 472 aa25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A3P48751 1232 aa25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 RIPK3Q9Y572 518 aa25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 AKR1A1P14550 325 aa25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 OAZ1P54368 228 aa25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 RNF180Q86T96 592 aa25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO40Q9UH90 709 aa25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 PDE1AP54750 535 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 SNX17Q15036 470 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 CHST13Q8NET6 341 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 FERMT2Q96AC1 680 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM232C9JQI7 657 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 TICAM2Q86XR7 235 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 PHF24Q9UPV7 400 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 TSPY2A6NKD2 308 aa24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 SLC1A4P43007 532 aa24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 STAT2P52630 851 aa24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 AAMPQ13685 434 aa24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 FAM160B2Q86V87 743 aa24.97■■□□□ 1.59
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NEDD8-201ENST00000250495 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 STX8Q9UNK0 236 aa24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 FOXP2O15409 715 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 PGK1P00558 417 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM60Q495X7 471 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-201ENST00000250495 LAMA3Q16787 3333 aa24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ALX1Q15699 326 aa24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB123Q8N688 67 aa24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 PLA2G6O60733 806 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 MCCP23508 829 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 VPS53Q5VIR6 699 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 INCENPQ9NQS7 918 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ACVR2BQ13705 512 aa24.93■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.93■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ORC4O43929 436 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ADAMTS4O75173 837 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TLE2Q04725 743 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TKFCQ3LXA3 575 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ACAD9Q9H845 621 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 FGAP02671 866 aa24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 FGRP09769 529 aa24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.91■■□□□ 1.58
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