RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.55■□□□□ 0.56
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HOXD3-201ENST00000249440 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD3-201ENST00000249440 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.54■□□□□ 0.56
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HOXD3-201ENST00000249440 ATP8B1O43520 1251 aa18.53■□□□□ 0.56
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HOXD3-201ENST00000249440 KCNJ12Q14500 433 aa18.52■□□□□ 0.56
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HOXD3-201ENST00000249440 M0R2N6 131 aa18.51■□□□□ 0.55
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HOXD3-201ENST00000249440 TSPY8P0CW00 308 aa18.51■□□□□ 0.55
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HOXD3-201ENST00000249440 TUBB2AQ13885 445 aa18.5■□□□□ 0.55
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HOXD3-201ENST00000249440 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa18.5■□□□□ 0.55
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HOXD3-201ENST00000249440 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 USP17L3A6NCW0 530 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 USP17L4A6NCW7 530 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 PLA2G4AP47712 749 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF569Q5MCW4 686 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD3-201ENST00000249440 CEP112Q8N8E3 955 aa18.49■□□□□ 0.55
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