RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 CLIC6Q96NY7 704 aa25.98■■□□□ 1.75
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RNF170-201ENST00000240159 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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RNF170-201ENST00000240159 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.97■■□□□ 1.75
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RNF170-201ENST00000240159 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.96■■□□□ 1.75
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RNF170-201ENST00000240159 KLRC3Q07444 240 aa25.94■■□□□ 1.74
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RNF170-201ENST00000240159 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.92■■□□□ 1.74
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RNF170-201ENST00000240159 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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RNF170-201ENST00000240159 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.9■■□□□ 1.74
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RNF170-201ENST00000240159 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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RNF170-201ENST00000240159 TIGD1Q96MW7 591 aa25.89■■□□□ 1.74
RNF170-201ENST00000240159 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
RNF170-201ENST00000240159 ECE1P42892 770 aa25.88■■□□□ 1.73
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RNF170-201ENST00000240159 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.88■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 ACER1Q8TDN7 264 aa25.88■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.88■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 TMX2Q9Y320 296 aa25.88■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 H7C1D1 291 aa25.88■■□□□ 1.73
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RNF170-201ENST00000240159 CSRNP2Q9H175 543 aa25.88■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 BMP3P12645 472 aa25.87■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 INF2Q27J81 1249 aa25.87■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 GPC2Q8N158 579 aa25.87■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.87■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 ADCY7P51828 1080 aa25.87■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 SYT17Q9BSW7 474 aa25.87■■□□□ 1.73
RNF170-201ENST00000240159 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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