RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 NR1D1P20393 614 aa23.73■■□□□ 1.39
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ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.68■■□□□ 1.38
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ODC1-201ENST00000234111 ITIH3Q06033 890 aa23.68■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.68■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.68■■□□□ 1.38
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ODC1-201ENST00000234111 LGALS16A8MUM7 142 aa23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 DNM1LO00429 736 aa23.67■■□□□ 1.38
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ODC1-201ENST00000234111 GDAQ9Y2T3 454 aa23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GUA9 196 aa23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ESYT3A0FGR9 886 aa23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 RPSAP08865 295 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 CARSP49589 748 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 CCDC181Q5TID7 509 aa23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
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