RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000194894.3

Ankrd39-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Limch1Q3UH68 1057 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tshz1Q5DTH5 1084 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Galk1Q9R0N0 392 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atp1a4Q9WV27 1032 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prom1O54990 867 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lmbrd2Q8C561 694 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atad2Q8CDM1 1040 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Onecut3Q8K557 490 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Bst2Q8R2Q8 172 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tomm70Q9CZW5 611 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Appbp2Q9DAX9 585 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ripor3A1L3T7 938 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cypt3B1AY64 174 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Otud7bB2RUR8 840 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Inpp5jP59644 1003 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fam170aQ66LM6 333 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Usp38Q8BW70 1042 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ttll1Q91V51 423 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mtmr4Q91XS1 1190 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ddit3P35639 168 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Srebf2Q3U1N2 1130 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atp13a3Q5XF89 1219 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tspyl2Q7TQI8 677 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Otop3Q80UF9 577 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Usp6nlQ80XC3 819 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nup133Q8R0G9 1155 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cep72Q9D3R3 646 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 TrioQ0KL02 3102 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif26aQ52KG5 1881 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dock3Q8CIQ7 2027 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tmem240B2RWJ3 173 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Smim22J3QP37 91 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tacc1Q6Y685 774 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rhobtb2Q91V93 728 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Msgn1Q9JK54 188 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ptpn12P35831 775 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Trim27Q62158 513 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ms4a5Q810P8 197 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 GldcQ91W43 1025 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 DaglbQ91WC9 669 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PdhbQ9D051 359 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zmym2Q9CU65 1376 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PatjQ63ZW7 1834 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 TroapB7ZNG4 668 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ankrd35E9Q9D8 996 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pbx2O35984 430 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lman2lP59481 347 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Entpd7Q3TCT4 606 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Phlda1Q62392 405 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Olfr118Q7TRJ6 321 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mcph1Q7TT79 822 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tdp1Q8BJ37 609 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc9a7Q8BLV3 726 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ttc12Q8BW49 704 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atg4aQ8C9S8 396 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Vps53Q8CCB4 832 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Stard7Q8R1R3 373 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 CutaQ9CQ89 177 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tbx20Q9ES03 445 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Hic1Q9R1Y5 733 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cep295Q8BQ48 2412 aa20.14■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 BC025446A0A087WQT1 134 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dennd3A2RT67 1274 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 EnamO55196 1274 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Glud1P26443 558 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gnat2P50149 354 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tp53i13Q5F267 385 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Phf24Q80TL4 400 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 FanclQ9CR14 375 aa20.13■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dnajc25A2ALW5 357 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm20503G3UZK1 150 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Defa-rs2P17534 91 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Snap25P60879 206 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Sap30bpQ02614 308 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dusp6Q9DBB1 381 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Znf287Q9EQB9 759 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Col5a3Q9JLI2 1739 aa20.12■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pate3B3GLJ3 98 aa20.11■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 SpibO35906 267 aa20.11■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 LdhbP16125 334 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Traf1P39428 409 aa20.11■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kcnh8P59111 1102 aa20.11■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gga3Q8BMI3 718 aa20.11■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.2 ms