RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hvcn1Q3U2S8 269 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 LdhdQ7TNG8 484 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dusp9Q7TNL7 452 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gmcl1Q920G9 524 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kctd10Q922M3 315 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tgm5Q9D7I9 724 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 ArcQ9WV31 396 aa21.46■■□□□ 1.03
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Clrn2B2RVW2 232 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mmp14P53690 582 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tshz1Q5DTH5 1084 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rasa3Q60790 834 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cnga2Q62398 664 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc172Q810N9 267 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ms4a5Q810P8 197 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Inpp5bQ8K337 993 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tesk2Q8VCT9 570 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trex1Q91XB0 314 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Brms1Q99N20 246 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dctpp1Q9QY93 170 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mx2Q9WVP9 655 aa21.45■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Magea6O89010 325 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cap1P40124 474 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map9Q3TRR0 646 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Magea3Q6T340 320 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cep128Q8BI22 1102 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Camkk2Q8C078 588 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tubgcp2Q921G8 905 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arpp21Q9DCB4 807 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa21.44■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm973E9Q295 1059 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rasa2P58069 847 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Oxr1Q4KMM3 866 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tmem39bQ810L4 492 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Clic6Q8BHB9 596 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Armc6Q8BNU0 468 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sox30Q8CGW4 782 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AdpgkQ8VDL4 496 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gpsm2Q8VDU0 679 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cul5Q9D5V5 780 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Acot3Q9QYR7 432 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm5134E9QAB5 671 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sdc2P43407 202 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Wnt10bP48614 389 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif5P59325 429 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rps12P63323 132 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Klrg2Q3UM83 387 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ndfip2Q91ZP6 311 aa21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa21.42■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Grin2dQ03391 1323 aa21.42■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Armc3A2AU72 881 aa21.42■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PsdQ5DTT2 1024 aa21.42■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prkab1Q9R078 270 aa21.42■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 SynrgQ5SV85 1306 aa21.42■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm7356A0A087WSA6 508 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc39a2G3X943 309 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vmn1r209Q5NC97 312 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddrgk1Q80WW9 315 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kcnk13Q8R1P5 405 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arl6ip4Q9JM93 229 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Serpina16D3Z660 418 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sun3Q5SS91 320 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Scfd2Q8BTY8 684 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf428Q8C1M2 176 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plcg2Q8CIH5 1265 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 E2f4Q8R0K9 410 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GrapQ9CX99 217 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sgpp1Q9JI99 430 aa21.41■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atrnl1Q6A051 1378 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NynrinQ5DTZ0 1840 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 OatP29758 439 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lgr6Q3UVD5 967 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Madcam1Q61826 405 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Oxsr1Q6P9R2 527 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 BccipQ9CWI3 316 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bcl11aQ9QYE3 773 aa21.4■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CluhQ5SW19 1315 aa21.39■■□□□ 1.02
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nr1i2O54915 431 aa21.39■■□□□ 1.01
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NyxP83503 476 aa21.39■■□□□ 1.01
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Psg29Q3URN6 468 aa21.39■■□□□ 1.01
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Txnrd2Q9JLT4 524 aa21.39■■□□□ 1.01
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NrapQ80XB4 1728 aa21.39■■□□□ 1.01
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Palm3A2TJV2 734 aa21.38■■□□□ 1.01
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nedd1P33215 660 aa21.38■■□□□ 1.01
Ldb1-201ENSMUST00000026252 LtbrP50284 415 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.4 ms