RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021990.3

Ptdss1-201, Transcript of Phosphatidylserine synthase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptdss1, Length 3,424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zfp597E9Q6S0 419 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Carmil2Q3V3V9 1296 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ulbp1Q8HWA3 334 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Abca3Q8R420 1704 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tmem47Q9JJG6 181 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Map3k15A2AQW0 1331 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 ByslO54825 436 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ess2O70279 479 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Aggf1Q7TN31 711 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Slc13a4Q8BZ82 625 aa16.2■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Aox3G3X982 1335 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 ErmardE9Q048 622 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lrrc6O88978 473 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc172Q810N9 267 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Hs2st1Q8R3H7 356 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Q91WD4 421 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tpp1O89023 562 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Scg2Q03517 617 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Trappc10Q3TLI0 1259 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Smarca1Q6PGB8 1046 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rasal3Q8C2K5 1041 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Scrn1Q9CZC8 414 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mad2l2Q9D752 211 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 CenphQ9QYM8 241 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Map7d2A2AG50 781 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm4307E9PZY4 289 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm4312K9J7E2 289 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ric8aQ3TIR3 530 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Asic3Q6X1Y6 530 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Spata32Q8C5V0 334 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 ParnQ8VDG3 624 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 1700018B08RikQ9DA83 213 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Adgra3Q7TT36 1310 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm7356A0A087WSA6 508 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tmem132bF7BAB2 1078 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 NpcdF8VQB8 469 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Npy5rO70342 466 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tdo2P48776 406 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Top1Q04750 767 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Copb2O55029 905 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 GpiP06745 558 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nf2P46662 596 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc105Q9D4K7 499 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Klf15Q9EPW2 415 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Spocd1B1ASB6 936 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Meis3P97368 378 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dok7Q18PE0 504 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ankrd13cQ3UX43 541 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tmem179Q8BHH9 233 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tmem63cQ8CBX0 802 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc96Q9CR92 584 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Trim30cD3YVI9 513 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nr1i2O54915 431 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pip4k2aO70172 405 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gjc1P28229 396 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zfp781Q0P5U5 243 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 KhnynQ80U38 671 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Setdb2Q8C267 713 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Q8C5C9 218 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Bicdl2Q8CHW5 507 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 IkbkbO88351 757 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mdh1P14152 334 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rtkn2Q14B46 604 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sugp2Q8CH09 1067 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lrrc41Q8K1C9 807 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gdap1l1Q8VE33 370 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Slc44a4Q91VA1 707 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Snrnp35Q9D384 244 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 FocadA2AKG8 1798 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ppfibp2O35711 882 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc51Q3URS9 406 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Fez2Q6TYB5 348 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cep95Q8BVV7 827 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Kif2bQ8C0N1 668 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Trmt112Q9DCG9 125 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 CluhQ5SW19 1315 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Akap11E9Q777 1895 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Kif23E9Q5G3 953 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Capn2O08529 700 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gna11P21278 359 aa16.16■□□□□ 0.18
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sap30bpQ02614 308 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms