RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	NUS1	Q12063	375 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	CLB2	P24869	491 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	LCL3	P53153	274 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ULA1	Q12059	462 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	GPA1	P08539	472 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	UIP3	P39547	235 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	EFM6	P53970	246 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	FRE7	Q12333	620 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ADY2	P25613	283 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	TFC3	P34111	1160 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RTS1	P38903	757 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	SMF1	P38925	575 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	PIG1	Q06216	648 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RRD2	Q12461	358 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	MBR1	P23493	339 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ELO1	P39540	310 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ASI1	P54074	624 aa		4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	PGS1	P25578	521 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	GEX1	P25596	615 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RSC1	P53236	928 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	APE1	P14904	514 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	GPI10	P30777	616 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	NUP133	P36161	1157 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	MAL33	P38157	468 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RCN2	Q12044	265 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	KIN3	P22209	435 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	OCA4	P25366	362 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	PRD1	P25375	712 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	SWC3	P31376	625 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	MRE11	P32829	692 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	PKP1	P40530	394 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	HXT9	P40885	567 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	CIR1	P42940	261 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	MRPL9	P31334	269 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	SLG1	P54867	378 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	INP53	Q12271	1107 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	GAL4	P04386	881 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
DSS1	YMR287C	BUD14	P27637	709 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	FTH1	P38310	465 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	MTG2	P38860	518 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YTP1	P53584	459 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	OSW1	Q08692	278 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	APN1	P22936	367 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	TSC10	P38342	320 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	OPT1	P40897	799 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	PKP2	P53170	491 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	YML037C	Q03703	340 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	RLM1	Q12224	676 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DSS1	YMR287C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	PXL1	P36166	706 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	JNM1	P36224	373 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	TIM44	Q01852	431 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	HUA2	Q12134	243 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	MRP13	P12686	339 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	RED1	P14291	827 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	PDX1	P16451	410 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	ADK2	P26364	225 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	YBL029W	P38201	376 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DSS1	YMR287C	YML6	P51998	286 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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