RNA–Protein interactions for RNA: YKR103W

NFT1, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene NFT1, Length 3,657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFT1	YKR103W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	PRM9	P39551	298 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	VAB2	P40003	282 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	HPM1	P40481	377 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	LSB6	P42951	607 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
NFT1	YKR103W	CCC1	P47818	322 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YTP1	P53584	459 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	OCA2	P53949	197 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SOV1	Q04748	898 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SEC10	Q06245	871 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	MHR1	Q06630	226 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	COQ4	O13525	335 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YLR302C	O13544	120 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	TPK2	P06245	380 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
NFT1	YKR103W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	CNA1	P23287	553 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YME1	P32795	747 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	MRPL10	P36520	322 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	COS111	P38308	924 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YER184C	P39961	794 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ZRG8	P40021	1076 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	TOK1	P40310	691 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ILM1	P47155	203 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SCW11	P53189	542 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	MTQ1	P53944	314 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	COG5	P53951	403 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YPL113C	Q02961	396 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	NSE5	Q03718	556 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ARP10	Q04549	284 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	VPS74	Q06385	345 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ARO10	Q06408	635 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	VPS54	Q12071	889 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YOR012W	Q12351	137 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	PHO13	P19881	312 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SAN1	P22470	610 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	CLB4	P24871	460 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	PRD1	P25375	712 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	MEI4	P29467	408 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	DAL1	P32375	460 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	VPS17	P32913	551 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	KAE1	P36132	386 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YER158C	P40095	573 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SSU1	P41930	458 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ERR3	P42222	437 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SPO74	P45819	413 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	HOP2	P53187	214 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YNL165W	P53891	406 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	FYV6	P53913	173 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	MRPL13	Q02204	264 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	GMC2	Q06201	188 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	GRS2	Q06817	618 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YOL114C	Q12322	202 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	BBP1	Q12365	385 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YOR111W	Q99210	232 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	NFU1	P32860	256 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	POP7	P38291	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	LNP1	P38878	278 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ACA1	P39970	489 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ICP55	P40051	511 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YIL165C	P40446	119 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	BNA6	P43619	295 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	TOM22	P49334	152 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	MPS2	P53159	387 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YMR210W	Q03649	449 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	ARA2	Q04212	335 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	GIS4	Q04233	774 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	DCR2	Q05924	578 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SGT1	Q08446	395 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	FRE8	Q12209	686 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YOL107W	Q12239	342 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	PEP5	P12868	1029 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	HOG1	P32485	435 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	MRPL16	P38064	232 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YBL086C	P38177	466 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NFT1	YKR103W	YHL041W	P38730	149 aa		2.74	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.1 ms