RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 DRP2Q13474 957 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SPDL1Q96EA4 605 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 GPC4O75487 556 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DNM3Q9UQ16 869 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PRXQ9BXM0 1461 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TTC39CQ8N584 583 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PHKBQ93100 1093 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CNPY3Q9BT09 278 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MAP3K7O43318 606 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PTPREP23469 700 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RASA3Q14644 834 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZUG5 572 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RNF34Q969K3 372 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MYO1EQ12965 1108 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM50Q86XT4 487 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 BANK1Q8NDB2 785 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 IQGAP2Q13576 1575 aa6.97□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 APOA4P06727 396 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CYP7A1P22680 504 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 NLRX1Q86UT6 975 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf229H3BNL8 230 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TXNDC9O14530 226 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 APOA1P02647 267 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PSMD1Q99460 953 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.96□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 H7C0S8 307 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 APOEP02649 317 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 FANCCQ00597 558 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 BIRC2Q13490 618 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 PBKQ96KB5 322 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 AZI2Q9H6S1 392 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 TMCC1O94876 653 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF6Q15052 776 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 SURF1Q15526 300 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 ACTN1P12814 892 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 CEP19Q96LK0 163 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 STAM2O75886 525 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 SDSP20132 328 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 PCYT1AP49585 367 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 FSCBQ5H9T9 825 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 EMBQ6PCB8 327 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 USP6NLQ92738 828 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 USP26Q9BXU7 913 aa6.96□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 ESYT2A0FGR8 921 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 FAM177BA6PVY3 158 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 AP3B1O00203 1094 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 IGSF3O75054 1194 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 MMEP08473 750 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 POSTNQ15063 836 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 MMEL1Q495T6 779 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 KLC3Q6P597 504 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 AK8Q96MA6 479 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 STOML1Q9UBI4 398 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 PTGS1P23219 599 aa6.95□□□□□ -1.3
SCN2A-209ENST00000636071 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms