RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614839.4

PRAMEF25-201, Transcript of PRAME family member 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF25, Length 1,863 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25-201ENST00000614839 FKBP1BP68106 108 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 PNMA1Q8ND90 353 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 WASF1Q92558 559 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 KLRG1Q96E93 195 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 DNAJC18Q9H819 358 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 TTLL1O95922 423 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 AKR1B1P15121 316 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 CEP95Q96GE4 821 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 MYL10Q9BUA6 226 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 CABP5Q9NP86 173 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 STK36Q9NRP7 1315 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 RXRAP19793 462 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 CDC27P30260 824 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 INPP5BP32019 993 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 NTRK3Q16288 839 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 DDX11Q96FC9 970 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 WRNIP1Q96S55 665 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 RASSF10A6NK89 507 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 TPM3P06753 285 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 DCAF15Q66K64 600 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 DOCK1Q14185 1865 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 SYCE3A1L190 88 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 H3BQV1 296 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 PKP1Q13835 747 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 IFFO2Q5TF58 517 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 NYAP2Q9P242 653 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 MAP3K9P80192 1104 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 VGLL4Q14135 290 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 GINM1Q9NU53 330 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25-201ENST00000614839 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 GRM1Q13255 1194 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 GRM4Q14833 912 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 RGMBQ6NW40 437 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 MKL1Q969V6 931 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 MTMR6Q9Y217 621 aa15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 DEXIO95424 95 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 VEGFBP49765 207 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 JAG1P78504 1218 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 PTPRFP10586 1907 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 F13A1P00488 732 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25-201ENST00000614839 SMARCA1P28370 1054 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms