RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608690.5

CBR3-AS1-208, CBR3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CBR3-AS1, Length 590 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TMEM87BQ96K49 555 aa12.04□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ZSWIM5Q9P217 1185 aa12.04□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 LAMB1P07942 1786 aa12.04□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SMIM22K7EJ46 135 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 EGFRP00533 1210 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 EPS15P42566 896 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 LIFRP42702 1097 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CDK8P49336 464 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ANTXR2P58335 489 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TCP10Q12799 353 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SART3Q15020 963 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 Q6ZUG5 572 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ZFPM1Q8IX07 1006 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 INCENPQ9NQS7 918 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CNTNAP1P78357 1384 aa12.03□□□□□ -0.48
CBR3-AS1-208ENST00000608690 MYH1P12882 1939 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TCP10L2B9ZVM9 353 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 FGD1P98174 961 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CCDC178Q5BJE1 867 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 BRICD5Q6PL45 260 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CYB5R4Q7L1T6 521 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 IQCA1Q86XH1 822 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TMTC2Q8N394 836 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TRPM4Q8TD43 1214 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 DYNLL2Q96FJ2 89 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 VRTNQ9H8Y1 702 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 VEZTQ9HBM0 779 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TOMM22Q9NS69 142 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 PGAP2Q9UHJ9 254 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa12.02□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ERICH2A1L162 156 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 IQCA1LA6NCM1 817 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 PRDM1O75626 825 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 FBXO45P0C2W1 286 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 JUNDP17535 347 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 RASA1P20936 1047 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CTHP32929 405 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 MAP3K10Q02779 954 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 PTPRNQ16849 979 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CHST3Q7LGC8 479 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SGMS1Q86VZ5 419 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 BRF1Q92994 677 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TMX3Q96JJ7 454 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CCDC17Q96LX7 622 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TCEANC2Q96MN5 208 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CSRNP1Q96S65 589 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 HACL1Q9UJ83 578 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 PLIN4Q96Q06 1357 aa12.01□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TSPY2A6NKD2 308 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SHMT1P34896 483 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 RCAN1P53805 252 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TFAP4Q01664 338 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CUL4AQ13619 759 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 RASA3Q14644 834 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SEC23AQ15436 765 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TMEM67Q5HYA8 995 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TATDN1Q6P1N9 297 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SCUBE3Q8IX30 993 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 SLC44A5Q8NCS7 719 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ARMC2Q8NEN0 867 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 NEDD1Q8NHV4 660 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ANKS1AQ92625 1134 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 LRRC2Q9BYS8 371 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 LY9Q9HBG7 655 aa12□□□□□ -0.49
CBR3-AS1-208ENST00000608690 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms