RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 PRC1O43663 620 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 BCRP11274 1271 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 LIFRP42702 1097 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 FAM160B2Q86V87 743 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 PNMA1Q8ND90 353 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 FKTNO75072 461 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 FLOT1O75955 427 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 SNHG28P0DPA3 235 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 DSG3P32926 999 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 ANTXR2P58335 489 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 SP3Q02447 781 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 FBXL16Q8N461 479 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 IL17RAQ96F46 866 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-212ENST00000596309 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ERO1AQ96HE7 468 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 MAP3K14Q99558 947 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 GNRH1P01148 92 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 PDHBP11177 359 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 STAT2P52630 851 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 KIF22Q14807 665 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 LBX1P52954 281 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CCNA1P78396 465 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF543Q08ER8 600 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CHST3Q7LGC8 479 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 IL27Q8NEV9 243 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 LY9Q9HBG7 655 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CPA4Q9UI42 421 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 PNMA2Q9UL42 364 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 DDAH1O94760 285 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CALM1P0DP23 149 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CALM2P0DP24 149 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CALM3P0DP25 149 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 COPB2P35606 906 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC96Q2M329 555 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 TSKSQ9UJT2 592 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 RLFQ13129 1914 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC69A6NI79 296 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 TMEM232C9JQI7 657 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 VWA5AO00534 786 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 SEC24BO95487 1268 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 RPS6KB1P23443 525 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 RCAN1P53805 252 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 OAZ1P54368 228 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ERVK-9P63128 1117 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ERVK-24P63145 666 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 RUFY3Q7L099 469 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 PARP14Q460N5 1801 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ATP2A1O14983 1001 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 ZBED4O75132 1171 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 FGD1P98174 961 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 TROAPQ12815 778 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-212ENST00000596309 HOXD10P28358 340 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-212ENST00000596309 MAPK4P31152 587 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-212ENST00000596309 KIF5BP33176 963 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-212ENST00000596309 FCGRTP55899 365 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-212ENST00000596309 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-212ENST00000596309 PPP2R5BQ15173 497 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-212ENST00000596309 KCTD1Q719H9 257 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-212ENST00000596309 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms