RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 SKOR1P84550 965 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ERFEQ4G0M1 354 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RESP18Q5W5W9 173 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 POTEAQ6S8J7 498 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 OLFM4Q6UX06 510 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CATIPQ7Z7H3 387 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCA1Q86XH1 822 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MPNDQ8N594 471 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PHKBQ93100 1093 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NGLY1Q96IV0 654 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GPCPD1Q9NPB8 672 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCF2Q9UG63 623 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 HPSEQ9Y251 543 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NHSQ6T4R5 1651 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RXRAP19793 462 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS72Q15906 364 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KANK3Q6NY19 840 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K14Q99558 947 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 LAMB1P07942 1786 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TNKSO95271 1327 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SOCS7O14512 581 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CCP110O43303 1012 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKAB2O43741 272 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SMC2O95347 1197 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPAQ15257 358 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 FANCBQ8NB91 859 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP3Q96P20 1036 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SETDB2Q96T68 719 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL10Q9BUA6 226 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NARFQ9UHQ1 456 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 A6NJR5 290 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MINDY4BA8MYZ0 360 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 AXIN1O15169 862 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ORC4O43929 436 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS6KA4O75676 772 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBB4AP04350 444 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GYG1P46976 350 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 USP46P62068 366 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL5Q02045 173 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC178Q5BJE1 867 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KRBA2Q6ZNG9 492 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CERS3Q8IU89 383 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIML1Q8N9V2 468 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CNNM3Q8NE01 707 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf37Q96NL8 207 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 AIFM3Q96NN9 605 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SENP2Q9HC62 589 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNH3Q9ULD8 1083 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CASZ1Q86V15 1759 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA1SQ13698 1873 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MYH13Q9UKX3 1938 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT2P35908 639 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNJ6P48051 423 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS8P62241 208 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GSTO1P78417 241 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE4BQ07343 736 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms