RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592316.1

APLP1-211, Transcript of amyloid beta precursor like protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene APLP1, Length 1,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1-211ENST00000592316 PNMA1Q8ND90 353 aa20.66■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.66■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.66■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 HTTP42858 3142 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 ASNSP08243 561 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 SLURP2P0DP57 97 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 CAP2P40123 477 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 GSE1Q14687 1217 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 RTN1Q16799 776 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 MKL1Q969V6 931 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.65■□□□□ 0.9
APLP1-211ENST00000592316 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CPLX1O14810 134 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 GDF11O95390 407 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 KIF5BP33176 963 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 GUCY1A2P33402 732 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ICA1Q05084 483 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 FANCBQ8NB91 859 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 KIF3AQ9Y496 699 aa20.64■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 BRD1O95696 1058 aa20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 GH2P01242 217 aa20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SEPT2Q15019 361 aa20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.63■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CENPFP49454 3210 aa20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 A0A1W2PPC1 479 aa20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 GNAQP50148 359 aa20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 GRM4Q14833 912 aa20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ARHGEF6Q15052 776 aa20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 MYL10Q9BUA6 226 aa20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 TRAK2O60296 914 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CTDNEP1O95476 244 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 IFNAR1P17181 557 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CDC27P30260 824 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 EFCC1Q9HA90 598 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 STK36Q9NRP7 1315 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 MYH4Q9Y623 1939 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 DOCK1Q14185 1865 aa20.61■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SNHG28P0DPA3 235 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 RXRAP19793 462 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 PDCP20941 246 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 GJB2P29033 226 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 NTRK3Q16288 839 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 RGS22Q8NE09 1264 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SH2D4AQ9H788 454 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 COL6A3P12111 3177 aa20.6■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 JAG1P78504 1218 aa20.59■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.59■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ZNF333Q96JL9 665 aa20.59■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.59■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 BRCA2P51587 3418 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SMARCA1P28370 1054 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
APLP1-211ENST00000592316 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
APLP1-211ENST00000592316 JAK2O60674 1132 aa20.57■□□□□ 0.88
APLP1-211ENST00000592316 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
APLP1-211ENST00000592316 PDHBP11177 359 aa20.57■□□□□ 0.88
APLP1-211ENST00000592316 ATP2B2Q01814 1243 aa20.57■□□□□ 0.88
APLP1-211ENST00000592316 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
APLP1-211ENST00000592316 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.57■□□□□ 0.88
APLP1-211ENST00000592316 MOB2Q70IA6 237 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms