RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 MROH8Q9H579 483 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 SH2D4AQ9H788 454 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 MAML3Q96JK9 1138 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 SEPT4O43236 478 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 PGK2P07205 417 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 RASA1P20936 1047 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 RTP1P59025 263 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 DEFB123Q8N688 67 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 REPS2Q8NFH8 660 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 OSBP2Q969R2 916 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 A0A0C4DFX4 3053 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-208ENST00000590422 VWA5AO00534 786 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 RAD21O60216 631 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 FCER1AP12319 257 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 GPR153Q6NV75 609 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 GOPCQ9HD26 462 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 MCM3APO60318 1980 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 M0R2C6 588 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A27O95847 323 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 LRRC41Q15345 812 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 TRIM60Q495X7 471 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SBK1Q52WX2 424 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 APPBP2Q92624 585 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 MMP19Q99542 508 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 DCTPP1Q9H773 170 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 CDH23Q9H251 3354 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 EYSQ5T1H1 3165 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 KBTBD13C9JR72 458 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 GPAA1O43292 621 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 NDUFB10O96000 172 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SNX17Q15036 470 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 PRDM1O75626 825 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 STAT3P40763 770 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 FERMT2Q96AC1 680 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 PGK1P00558 417 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 KCTD2Q14681 263 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 GPATCH3Q96I76 525 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 TINF2Q9BSI4 451 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 NYAP2Q9P242 653 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 RIPK3Q9Y572 518 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 F5H6K3 240 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 TDO2P48775 406 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 KLRC3Q07444 240 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 CEP95Q96GE4 821 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-208ENST00000590422 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms