RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585752.5

ATG4D-203, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 729 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-203ENST00000585752 RLFQ13129 1914 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 H0YGN5 161 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 SLC34A2O95436 690 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 TSPY3P0CV98 308 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 TSPY8P0CW00 308 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 ERCC3P19447 782 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 GRB14Q14449 540 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 CCL14Q16627 93 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 ATG4CQ96DT6 458 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 PRDM1O75626 825 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 SLC25A27O95847 323 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 CNGA1P29973 690 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 TTC22Q5TAA0 569 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 NBPF3Q9H094 633 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 NYAP2Q9P242 653 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 TICAM2Q86XR7 235 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-203ENST00000585752 HIP1O00291 1037 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 FCER1AP12319 257 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 ADORA2AP29274 412 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 PPARAQ07869 468 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 F5H6K3 240 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 TTLL1O95922 423 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 HOXC6P09630 235 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 COPB2P35606 906 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 KLRC3Q07444 240 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 MSCO60682 206 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 TSPY2A6NKD2 308 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 STAT3P40763 770 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 TFAP4Q01664 338 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 KCTD2Q14681 263 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 MMP19Q99542 508 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 VWA5AO00534 786 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 ZBED4O75132 1171 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 SLC4A3P48751 1232 aa22.16■■□□□ 1.14
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ATG4D-203ENST00000585752 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 CEP95Q96GE4 821 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 TOMM22Q9NS69 142 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 NDUFB10O96000 172 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 SDSP20132 328 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 CYP2C19P33261 490 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-203ENST00000585752 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 MKL1Q969V6 931 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 KIFC2Q96AC6 838 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 FEM1BQ9UK73 627 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 ALPK3Q96L96 1907 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 SLFN13Q68D06 897 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-203ENST00000585752 FAM227BQ96M60 508 aa22.13■■□□□ 1.13
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