RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 BTBD7Q9P203 1132 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ALPK3Q96L96 1907 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0D9SFI3 127 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 TSPY2A6NKD2 308 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 F5H6K3 240 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CNMDO75829 334 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 HMGCRP04035 888 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SDSP20132 328 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 RGS2P41220 211 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 GJA8P48165 433 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 KLRC3Q07444 240 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 VPS53Q5VIR6 699 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 LBX2Q6XYB7 198 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 TICAM2Q86XR7 235 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MB21D1Q8N884 522 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SHISA4Q96DD7 197 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ATG4CQ96DT6 458 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB118Q96PH6 123 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 NYAP2Q9P242 653 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 HIP1O00291 1037 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SGPL1O95470 568 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 TTLL1O95922 423 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 FGAP02671 866 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 PTPREP23469 700 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SLC4A3P48751 1232 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MAP2K5Q13163 448 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 DPP9Q86TI2 863 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CEP95Q96GE4 821 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 INCENPQ9NQS7 918 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 RPTORQ8N122 1335 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB10O96000 172 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ERCC3P19447 782 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM32Q13049 653 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ALX1Q15699 326 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MORN1Q5T089 497 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 TRIB2Q92519 343 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 DPF3Q92784 378 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 STX8Q9UNK0 236 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CEP290O15078 2479 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 LAMA4Q16363 1823 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 FOXP2O15409 715 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 STRNO43815 780 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ZBED4O75132 1171 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 HAND2P61296 217 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 CCL14Q16627 93 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SLFN13Q68D06 897 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MKL1Q969V6 931 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 KIFC2Q96AC6 838 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 APBA2Q99767 749 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MROH8Q9H579 483 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 MTMR7Q9Y216 660 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 VWA5AO00534 786 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF213O14771 459 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A27O95847 323 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 FCER1AP12319 257 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-214ENST00000583153 BMP3P12645 472 aa9.84□□□□□ -0.83
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