RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580813.1

VNN3-214, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 5

Gene VNN3, Length 558 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-214ENST00000580813 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.49□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.49□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 DLG4P78352 724 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 HDAC8Q9BY41 377 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 GMIPQ9P107 970 aa8.48□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.47□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.47□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 TCTN2Q96GX1 697 aa8.47□□□□□ -1.05
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VNN3-214ENST00000580813 LRRC3Q9BY71 257 aa8.47□□□□□ -1.05
VNN3-214ENST00000580813 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.47□□□□□ -1.05
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VNN3-214ENST00000580813 PEX10O60683 326 aa8.46□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 LILRA6Q6PI73 481 aa8.46□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 SHISA4Q96DD7 197 aa8.46□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 GGT7Q9UJ14 662 aa8.46□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 TCFL5Q9UL49 500 aa8.46□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 FKTNO75072 461 aa8.45□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 SEMA7AO75326 666 aa8.45□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 ATE1O95260 518 aa8.45□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.45□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.44□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 OR14I1A6ND48 311 aa8.44□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.44□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.44□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 NOTOA8MTQ0 251 aa8.43□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.43□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 ATG4CQ96DT6 458 aa8.43□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 MAP6Q96JE9 813 aa8.43□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 CLCQ05315 142 aa8.42□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 APOBRQ0VD83 1088 aa8.42□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.42□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.42□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.42□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.42□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.42□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 TMEM82A0PJX8 343 aa8.41□□□□□ -1.06
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VNN3-214ENST00000580813 GCM1Q9NP62 436 aa8.41□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 MEIS1O00470 390 aa8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 SIGLEC6O43699 453 aa8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 BBS9Q3SYG4 887 aa8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 BCL11AQ9H165 835 aa8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 CHST7Q9NS84 486 aa8.4□□□□□ -1.06
VNN3-214ENST00000580813 SDHBP21912 280 aa8.39□□□□□ -1.07
VNN3-214ENST00000580813 CCNFP41002 786 aa8.39□□□□□ -1.07
VNN3-214ENST00000580813 ZNF165P49910 485 aa8.39□□□□□ -1.07
VNN3-214ENST00000580813 RTP1P59025 263 aa8.39□□□□□ -1.07
VNN3-214ENST00000580813 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VNN3-214ENST00000580813 ZNF385BQ569K4 471 aa8.39□□□□□ -1.07
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