RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572085.5

TP53BP1-216, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 2

Gene TP53BP1, Length 5,574 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-216	ENST00000572085	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	MEIS3	Q99687	375 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	UST	Q9Y2C2	406 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	LGSN	Q5TDP6	509 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	HSF2BP	O75031	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ASNS	P08243	561 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	POLK	Q9UBT6	870 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ABCD1	P33897	745 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PRR16	Q569H4	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	TRIM27	P14373	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	POSTN	Q15063	836 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC6	Q16204	474 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	RXRA	P19793	462 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	HSPA1L	P34931	641 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SPTLC2	O15270	562 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	UBXN1	Q04323	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	MYO1E	Q12965	1108 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CUL7	Q14999	1698 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	STAM2	O75886	525 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	GYG1	P46976	350 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	NME8	Q8N427	588 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	GPAA1	O43292	621 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SEC24B	O95487	1268 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PTGS1	P23219	599 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SMCO2	A6NFE2	343 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	KRT86	O43790	486 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PTGDR	Q13258	359 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	AAAS	Q9NRG9	546 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	UBASH3A	P57075	661 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	TSPY1	Q01534	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	FCER1A	P12319	257 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CHRND	Q07001	517 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	MAN1A1	P33908	653 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	USP17L21	D6R901	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085		K7ENM7	598 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	PHKG2	P15735	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP1-216	ENST00000572085	LMNB1	P20700	586 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms