RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567365.2

RNF40-211, Transcript of ring finger protein 40, humanhuman

TSL 3

Gene RNF40, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40-211ENST00000567365 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.64□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.64□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 STX8Q9UNK0 236 aa14.64□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.64□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 SNHG28P0DPA3 235 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ANTXR2P58335 489 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 Q3C1V9 767 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 SLFN13Q68D06 897 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 RASEFQ8IZ41 740 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 REPS2Q8NFH8 660 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 BTBD7Q9P203 1132 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PLXNB2O15031 1838 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PLA2G6O60733 806 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ERVK-9P63128 1117 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ERVK-24P63145 666 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 IQCA1Q86XH1 822 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 FLOT1O75955 427 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 GNRH1P01148 92 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 NCOA7Q8NI08 942 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ATG4CQ96DT6 458 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 EFCC1Q9HA90 598 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 TNKSO95271 1327 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PDHBP11177 359 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 BMP3P12645 472 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 HSPA4P34932 840 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PSMC4P43686 418 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 MB21D1Q8N884 522 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PORCNQ9H237 461 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 TRIM17Q9Y577 477 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 VWA5AO00534 786 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 REC8O95072 547 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 MCCP23508 829 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 TRDNQ13061 729 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 DCAF4Q8WV16 495 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 MTA3Q9BTC8 594 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 USP26Q9BXU7 913 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 SENP2Q9HC62 589 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 SRRDQ9UH36 339 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 GJD2Q9UKL4 321 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.59□□□□□ -0.07
RNF40-211ENST00000567365 ATP2A1O14983 1001 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 SLC1A4P43007 532 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 PRMT2P55345 433 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 FCGRTP55899 365 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 ZNF543Q08ER8 600 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 KIF22Q14807 665 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 RNF20Q5VTR2 975 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 KCTD1Q719H9 257 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 PNMA1Q8ND90 353 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 USP6NLQ92738 828 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 FEM1BQ9UK73 627 aa14.58□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 TMEM232C9JQI7 657 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 RAD21O60216 631 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 ARHGEF6Q15052 776 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 CHST3Q7LGC8 479 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 GABRQQ9UN88 632 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.57□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 FDX1P10109 184 aa14.56□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 MAPK4P31152 587 aa14.56□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 MCM5P33992 734 aa14.56□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 STAT2P52630 851 aa14.56□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 PRKCZQ05513 592 aa14.56□□□□□ -0.08
RNF40-211ENST00000567365 TROAPQ12815 778 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms