RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	TREH	O43280	583 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	BRD1	O95696	1058 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	FSHB	P01225	129 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	GIPC1	O14908	333 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRN2	O75325	713 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SDHB	P21912	280 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGA2	P52926	109 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE4B	Q07343	736 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	MPO	P05164	745 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK1	P28482	360 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGB3	P05106	788 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	CPZ	Q66K79	652 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL4A	P40617	200 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT6	Q14141	434 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	CYR61	O00622	381 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	SLPI	P03973	132 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	C6	P13671	934 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	GDF5	P43026	501 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	RTP1	P59025	263 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AKAP13-223	ENST00000560957	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF20	P17024	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PFKL	P17858	780 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LMNB1	P20700	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TACR2	P21452	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LIMS1	P48059	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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