RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	RLF	Q13129	1914 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	C19orf81	C9J6K1	198 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	CNMD	O75829	334 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	FGR	P09769	529 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TNKS	O95271	1327 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ORC4	O43929	436 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	BCR	P11274	1271 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	RAD50	Q92878	1312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ELN	P15502	786 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PRKCZ	Q05513	592 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC174	Q6PII3	467 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	ESR2	Q92731	530 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	OSBP	P22059	807 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC1A4	P43007	532 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	USP14	P54578	494 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM32	Q13049	653 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	ERVK-24	P63145	666 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PARP14	Q460N5	1801 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	COG2	Q14746	738 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	CCL14	Q16627	93 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	MGAM	O43451	1857 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	BMP3	P12645	472 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP2B6	P20813	491 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	VWA5A	O00534	786 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PRC1	O43663	620 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PGK2	P07205	417 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PDHB	P11177	359 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	DSG3	P32926	999 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	FLT3LG	P49771	235 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	TRDN	Q13061	729 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	SEC23A	Q15436	765 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM227B-208	ENST00000559573	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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