RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADD2P35612 726 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANO1Q5XXA6 986 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 REPS2Q8NFH8 660 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYH7P12883 1935 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIAA0355O15063 1070 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDK8P49336 464 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TINF2Q9BSI4 451 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARMT1Q9H993 441 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDH23Q9H251 3354 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TTC28Q96AY4 2481 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VWA5AO00534 786 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRKAB2O43741 272 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADAMTS4O75173 837 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ITGB8P26012 769 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COPB2P35606 906 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TLE2Q04725 743 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PLS1Q14651 629 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM161BQ96MY7 647 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VCANP13611 3396 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMIM22K7EJ46 135 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MBD4O95243 580 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RARBP10826 455 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATP5JP18859 108 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UBE3CQ15386 1083 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TOX2Q96NM4 488 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MMP19Q99542 508 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 A0A1W2PQY0 241 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RAB11FIP3O75154 756 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CLTBP09497 229 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RNF180Q86T96 592 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PANK1Q8TE04 598 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FERMT2Q96AC1 680 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HAUS7Q99871 368 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USP17L12C9JPN9 530 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USP17L21D6R901 530 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATP2A1O14983 1001 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PGK2P07205 417 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AKR1A1P14550 325 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 STAT3P40763 770 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EPHB4P54760 987 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KCTD2Q14681 263 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GOPCQ9HD26 462 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EYSQ5T1H1 3165 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HMMRO75330 724 aa16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PGK1P00558 417 aa16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLFNL1Q499Z3 407 aa16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CTR9Q6PD62 1173 aa16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAAP100Q0VG06 881 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYLIPQ8WY64 445 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHGBP05060 677 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms