RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 ERCC3P19447 782 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 GRB14Q14449 540 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 CCL14Q16627 93 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 MYH4Q9Y623 1939 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 F5H6K3 240 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 TTLL1O95922 423 aa21.87■■□□□ 1.09
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NEDD1-208ENST00000555806 KLRC3Q07444 240 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 NDUFB10O96000 172 aa21.86■■□□□ 1.09
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NEDD1-208ENST00000555806 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 TSPY2A6NKD2 308 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 SDSP20132 328 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 ALX1Q15699 326 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.85■■□□□ 1.09
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NEDD1-208ENST00000555806 DPP9Q86TI2 863 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 MROH8Q9H579 483 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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NEDD1-208ENST00000555806 STRNO43815 780 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 ADORA2AP29274 412 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 MKL1Q969V6 931 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 INCENPQ9NQS7 918 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 TOMM22Q9NS69 142 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.83■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 SLC25A27O95847 323 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD1-208ENST00000555806 DPF3Q92784 378 aa21.83■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD1-208ENST00000555806 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD1-208ENST00000555806 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 SLFN13Q68D06 897 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 STAT3P40763 770 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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NEDD1-208ENST00000555806 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 STX8Q9UNK0 236 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 ZMYM6O95789 1325 aa21.8■■□□□ 1.08
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NEDD1-208ENST00000555806 REPS2Q8NFH8 660 aa21.8■■□□□ 1.08
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NEDD1-208ENST00000555806 PDE4AP27815 886 aa21.79■■□□□ 1.08
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NEDD1-208ENST00000555806 MMP19Q99542 508 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 COBLO75128 1261 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 ZBED4O75132 1171 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 CNGA1P29973 690 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 SLC4A3P48751 1232 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 KCTD2Q14681 263 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD1-208ENST00000555806 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.78■■□□□ 1.08
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