RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 AP5Z1O43299 807 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 KINO60870 393 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 FANCBQ8NB91 859 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 GUCY1A2P33402 732 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 NTRK3Q16288 839 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 STX1AQ16623 288 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 MICU3Q86XE3 530 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 MKL1Q969V6 931 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 HOOK2Q96ED9 719 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 TTLL1O95922 423 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 CDC27P30260 824 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 ZNF165P49910 485 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.49■■□□□ 1.03
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LRP1-204ENST00000553277 NYAP2Q9P242 653 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 STK36Q9NRP7 1315 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 CDC25BP30305 580 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 ME1P48163 572 aa21.48■■□□□ 1.03
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LRP1-204ENST00000553277 SARM1Q6SZW1 724 aa21.48■■□□□ 1.03
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LRP1-204ENST00000553277 PNMA1Q8ND90 353 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 MYL10Q9BUA6 226 aa21.48■■□□□ 1.03
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LRP1-204ENST00000553277 GINM1Q9NU53 330 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 STX8Q9UNK0 236 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 JAG1P78504 1218 aa21.47■■□□□ 1.03
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LRP1-204ENST00000553277 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP1-204ENST00000553277 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.47■■□□□ 1.03
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LRP1-204ENST00000553277 FOSBP53539 338 aa21.45■■□□□ 1.02
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LRP1-204ENST00000553277 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.45■■□□□ 1.02
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LRP1-204ENST00000553277 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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LRP1-204ENST00000553277 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.44■■□□□ 1.02
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LRP1-204ENST00000553277 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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