RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 CCNA1P78396 465 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TRIM32Q13049 653 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TRIB2Q92519 343 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 UBXN2AP68543 259 aa24.77■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.77■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.77■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 HIP1O00291 1037 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 MB21D1Q8N884 522 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 RNF208Q9H0X6 261 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 PARP14Q460N5 1801 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 TSPY2A6NKD2 308 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 HMGCRP04035 888 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 PTPREP23469 700 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 CCL14Q16627 93 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 WDR78Q5VTH9 848 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 SKAP1Q86WV1 359 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 REPS2Q8NFH8 660 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 VWA5AO00534 786 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 GJB1P08034 283 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 ERCC3P19447 782 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 GRB14Q14449 540 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 NOVP48745 357 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 MAP2K5Q13163 448 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 APBA2Q99767 749 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 NEDD4P46934 1319 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 RGS2P41220 211 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 GJA8P48165 433 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 PLS1Q14651 629 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 MYH4Q9Y623 1939 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 CHMLP26374 656 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 SLFN13Q68D06 897 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 TOMM22Q9NS69 142 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 STX8Q9UNK0 236 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-222ENST00000550996 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.7■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 HOXC6P09630 235 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 DEFB118Q96PH6 123 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 IGHA2P01877 340 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 ADORA2AP29274 412 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 GMCL1Q96IK5 515 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 MROH8Q9H579 483 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 RAD50Q92878 1312 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 ZNF213O14771 459 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 COBLO75128 1261 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 SGPL1O95470 568 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 BMP3P12645 472 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 MCCP23508 829 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 STAT3P40763 770 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 KIFC2Q96AC6 838 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 FEM1BQ9UK73 627 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 RPTORQ8N122 1335 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 RIPK3Q9Y572 518 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 TMEM232C9JQI7 657 aa24.65■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 STRNO43815 780 aa24.65■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 SLC25A27O95847 323 aa24.65■■□□□ 1.54
CS-222ENST00000550996 SLC1A4P43007 532 aa24.65■■□□□ 1.54
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