RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTC6Q86TZ1 520 aa23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERC2O15083 957 aa23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP2D6P10635 497 aa23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRIN2CQ14957 1233 aa23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 BTBD7Q9P203 1132 aa23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 VCAM1P19320 739 aa23.1■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 EHD4Q9H223 541 aa23.1■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLTBP09497 229 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJB2P25686 324 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADORA2AP29274 412 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLA2G5P39877 138 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 TLE2Q04725 743 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC41Q15345 812 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP38Q8NB14 1042 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 FERMT2Q96AC1 680 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 LNPKQ9C0E8 428 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.09■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMIM22K7EJ46 135 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAG1P15918 1043 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHMT1P34896 483 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANO1Q5XXA6 986 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMC5Q8IY18 1101 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 OSBP2Q969R2 916 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF576Q9H609 170 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYH8P13535 1937 aa23.08■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA0355O15063 1070 aa23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 FPGSQ05932 587 aa23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM122AQ96E09 287 aa23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDE1AP54750 535 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 GABPAQ06546 454 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 APPBP2Q92624 585 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 CABP5Q9NP86 173 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHF24Q9UPV7 400 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCOR1O75376 2440 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 M0R2C6 588 aa23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITGB8P26012 769 aa23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 COG2Q14746 738 aa23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 TIFAQ96CG3 184 aa23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASB2Q96Q27 587 aa23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 FSD1Q9BTV5 496 aa23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L12C9JPN9 530 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L21D6R901 530 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPHB4P54760 987 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF180Q86T96 592 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 THEGQ9P2T0 379 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.04■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 RARBP10826 455 aa23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 MB21D1Q8N884 522 aa23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 MROH8Q9H579 483 aa23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPAA1O43292 621 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 COBLO75128 1261 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERCC3P19447 782 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 C12orf60Q5U649 245 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTR9Q6PD62 1173 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 IL27Q8NEV9 243 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACER1Q8TDN7 264 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.02■■□□□ 1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.01■■□□□ 1.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 GUCY1A2P33402 732 aa23.01■■□□□ 1.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUCB1Q02818 461 aa23.01■■□□□ 1.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms